158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0948 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0948  DNA polymerase I  100 
 
 		 852 aa  1749    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.158363 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0298  DNA polymerase I  43.18 
 
 		 835 aa  692    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1361  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 854 aa  635    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0144  DNA polymerase I  40.92 
 
 		 871 aa  663    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.248865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0798  DNA polymerase I  40.12 
 
 		 853 aa  641    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0816  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 854 aa  634  1e-180  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.766661  hitchhiker  0.00661096 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1087  DNA polymerase I  39.55 
 
 		 853 aa  632  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1907  DNA polymerase I  39.74 
 
 		 877 aa  612  1e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.488214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1620  DNA-directed DNA polymerase  39.32 
 
 		 882 aa  598  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0874595  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1258  replicative DNA polymerase I  28.8 
 
 		 780 aa  191  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0530  DNA polymerase Pol2  29.24 
 
 		 781 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1378  DNA polymerase Pol2  29.05 
 
 		 780 aa  188  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00266736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1049  DNA polymerase II  24.75 
 
 		 783 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0144376 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0393  DNA polymerase II  25.89 
 
 		 794 aa  173  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1367  DNA polymerase Pol2  27.71 
 
 		 810 aa  172  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.815142  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1342  DNA polymerase Pol2  25.49 
 
 		 781 aa  169  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000227387  normal  0.522725 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0653  DNA polymerase Pol2  28.33 
 
 		 811 aa  170  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0961  DNA polymerase II  24.18 
 
 		 785 aa  168  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1320  DNA polymerase II  24.45 
 
 		 784 aa  165  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.4978 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2154  DNA polymerase II  26.74 
 
 		 783 aa  165  4.0000000000000004e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000768017  hitchhiker  0.000641936 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1884  DNA polymerase II  23.54 
 
 		 786 aa  162  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44713  predicted protein  25.1 
 
 		 982 aa  127  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1316  DNA-directed DNA polymerase  24.32 
 
 		 784 aa  126  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1210  DNA polymerase B region  26.99 
 
 		 723 aa  127  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.219967  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86981  DNA-directed DNA polymerase alpha Required for mitotic DNA synthesis, premeiotic DNA synthesis, recombination, and full sporulation  28.96 
 
 		 1463 aa  125  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54677  DNA polymerase delta  25.62 
 
 		 1087 aa  124  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63206  DNA polymerase delta catalytic subunit (DNA polymerase III)  24.8 
 
 		 1070 aa  116  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1740  DNA polymerase B region  24.6 
 
 		 795 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.883106  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04130  DNA polymerase alpha catalytic subunit, putative  30.43 
 
 		 1485 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1688  replicative DNA polymerase I  22.75 
 
 		 910 aa  115  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00560  delta DNA polymerase, putative  23.98 
 
 		 1058 aa  109  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3264  DNA polymerase I  23.53 
 
 		 716 aa  108  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1156  DNA polymerase B region  24.57 
 
 		 818 aa  108  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.809491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0375  DNA polymerase B region  26.36 
 
 		 1353 aa  108  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1511  DNA polymerase II  24.25 
 
 		 794 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2210  DNA polymerase II  24.2 
 
 		 782 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.40989 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07325  catalytic subunit of DNA polymerase delta (Eurofung)  25.15 
 
 		 1044 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3734  DNA polymerase II  23.19 
 
 		 787 aa  105  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4655  DNA polymerase II  22.82 
 
 		 791 aa  105  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.230041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1891  DNA polymerase I  24.63 
 
 		 768 aa  104  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1999  DNA polymerase II  23.42 
 
 		 786 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01452  DNA polymerase II  24.48 
 
 		 790 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0922  DNA-directed DNA polymerase  24.79 
 
 		 607 aa  102  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.434202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1777  replicative DNA polymerase I  25.22 
 
 		 932 aa  101  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.227569  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10755  catalytic subunit of the DNA polymerase alpha-primase complex (Eurofung)  28.86 
 
 		 1459 aa  101  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2629  DNA polymerase II  25.38 
 
 		 792 aa  101  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.085046  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1397  DNA polymerase Pol2  21.79 
 
 		 941 aa  101  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.61356  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3658  DNA polymerase II  22.89 
 
 		 792 aa  101  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0583295  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3085  DNA polymerase II  23.82 
 
 		 807 aa  100  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000404512  hitchhiker  0.0000370941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0731  DNA polymerase II  24.5 
 
 		 787 aa  100  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.13833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0109  DNA polymerase II  24.44 
 
 		 783 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0102  DNA polymerase II  24.32 
 
 		 783 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0062  DNA polymerase II  23.55 
 
 		 783 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0283986  normal  0.967142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00062  DNA polymerase II  22.82 
 
 		 783 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2621  DNA polymerase II  23.14 
 
 		 787 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00407821  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00061  hypothetical protein  22.82 
 
 		 783 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0616  hypothetical protein  24.68 
 
 		 796 aa  99.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0104  DNA polymerase II  24.28 
 
 		 783 aa  100  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3539  DNA-directed DNA polymerase  22.68 
 
 		 783 aa  99  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0052  DNA polymerase II  22.68 
 
 		 783 aa  99.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3597  DNA polymerase II  22.68 
 
 		 783 aa  99  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326268 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0062  DNA polymerase II  23.52 
 
 		 783 aa  99.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00931565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2361  DNA polymerase II  22.86 
 
 		 787 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168731  normal  0.46504 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0103  DNA polymerase II  24.12 
 
 		 783 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.249231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0065  DNA polymerase II  22.93 
 
 		 783 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0064  DNA polymerase II  22.54 
 
 		 783 aa  97.8  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406876  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1653  DNA polymerase II  24.3 
 
 		 809 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.112928  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0929  DNA polymerase II  22.32 
 
 		 816 aa  97.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193818  normal  0.499363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1514  DNA polymerase II  24.09 
 
 		 797 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4331  DNA polymerase II  22.71 
 
 		 794 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333031 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2724  DNA polymerase II  24.3 
 
 		 809 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000453184  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0831  DNA polymerase II  23.78 
 
 		 787 aa  96.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134615  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1499  DNA-directed DNA polymerase  30 
 
 		 912 aa  96.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5012  DNA polymerase II  22.54 
 
 		 794 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5848  DNA polymerase II  22.54 
 
 		 794 aa  95.5  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.595461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0798  DNA polymerase B region  24.9 
 
 		 812 aa  95.9  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189737  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_297  predicted protein  28.82 
 
 		 990 aa  95.9  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400359  normal  0.313206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1903  DNA polymerase II  22.65 
 
 		 786 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.856945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1250  DNA polymerase II  22.79 
 
 		 801 aa  95.5  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0167112  hitchhiker  0.000178487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1630  DNA polymerase II  23.93 
 
 		 809 aa  95.5  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00018706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1619  DNA polymerase II  23.89 
 
 		 809 aa  95.1  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000233393  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3002  DNA polymerase II  23.11 
 
 		 793 aa  94.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.789945  normal  0.339701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3546  DNA polymerase II  23.61 
 
 		 789 aa  94.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2947  DNA polymerase II  23.61 
 
 		 789 aa  94.4  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.670904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3418  DNA polymerase II  23.61 
 
 		 789 aa  94.4  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1567  DNA polymerase II  24.13 
 
 		 793 aa  94.4  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253112  hitchhiker  0.0000162261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5084  DNA polymerase II  22.95 
 
 		 788 aa  94.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1645  DNA polymerase II  21.79 
 
 		 789 aa  94  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0528782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40120  DNA polymerase II  22.88 
 
 		 787 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2482  DNA polymerase II  23.62 
 
 		 795 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.205655  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3400  DNA polymerase II  23.3 
 
 		 788 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3630  DNA polymerase II  23.55 
 
 		 786 aa  93.2  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3234  DNA polymerase II  22.99 
 
 		 788 aa  92.8  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2393  DNA polymerase II  22.88 
 
 		 786 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3302  DNA polymerase II  22.88 
 
 		 786 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1108  DNA polymerase B region  24.82 
 
 		 821 aa  92.4  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42537  normal  0.497226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4584  DNA polymerase II  22.48 
 
 		 788 aa  91.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0839  DNA polymerase I  26.75 
 
 		 655 aa  91.3  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.148048 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2300  DNA polymerase B region  27.65 
 
 		 552 aa  90.9  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2629  DNA polymerase II  23.2 
 
 		 810 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0639534  hitchhiker  0.0000529366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>