More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0914 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0914  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
258 aa  523  1e-147  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1788  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.08 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.18 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1169  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.39 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.949378  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0856  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.07 
 
 
262 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1306  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.73 
 
 
262 aa  167  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0074  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.87 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.43 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.32 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1271  Indole-3-glycerol phosphate synthase  38.99 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3039  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
267 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0932911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.44 
 
 
265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.03 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.03 
 
 
266 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.43 
 
 
266 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.38 
 
 
271 aa  160  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.79 
 
 
265 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.01 
 
 
267 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2818  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.48 
 
 
289 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37 
 
 
263 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1952  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.05 
 
 
261 aa  157  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0048932  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.56 
 
 
266 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.92 
 
 
263 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.53 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.52 
 
 
275 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.5 
 
 
258 aa  155  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.32 
 
 
269 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0159  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.16 
 
 
267 aa  155  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.927898  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.96 
 
 
265 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.34 
 
 
267 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.84 
 
 
258 aa  154  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.17 
 
 
295 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.86 
 
 
259 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.29 
 
 
285 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3172  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.81 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.53 
 
 
271 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.05 
 
 
258 aa  152  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  32.46 
 
 
268 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.2 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.4 
 
 
258 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.24 
 
 
270 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3845  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.38 
 
 
271 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2885  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
267 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.733031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.74 
 
 
293 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.59 
 
 
266 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.35 
 
 
271 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6214  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.57 
 
 
270 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.73 
 
 
273 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.32 
 
 
264 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.57 
 
 
270 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.39 
 
 
267 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1685  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.61 
 
 
250 aa  149  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.159562  normal  0.0633733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.56 
 
 
265 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.25 
 
 
270 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.48 
 
 
263 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.56 
 
 
285 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.56 
 
 
285 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.1 
 
 
268 aa  149  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.3 
 
 
293 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.7 
 
 
266 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.21 
 
 
267 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.77 
 
 
268 aa  148  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3097  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.68 
 
 
270 aa  148  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  normal  0.58213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0710  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.57 
 
 
270 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.251699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.39 
 
 
271 aa  148  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3127  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.45 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal  0.570682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.91 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.39 
 
 
274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.09 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  39.15 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0216  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.53 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2762  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.1 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.14 
 
 
266 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.66 
 
 
288 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0460  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.89 
 
 
261 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.38 
 
 
266 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2466  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37 
 
 
272 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00979183  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.89 
 
 
261 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.11 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  36.92 
 
 
265 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3293  indole-3-glycerolphosphate synthase  39.23 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.98 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.22 
 
 
264 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.09 
 
 
259 aa  145  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3876  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.92 
 
 
262 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.87 
 
 
271 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.4 
 
 
295 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.71 
 
 
278 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.53 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.32 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0107  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.35 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.71 
 
 
278 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3559  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.09 
 
 
261 aa  145  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.723493  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.04 
 
 
266 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2701  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.11 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3578  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.09 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.04 
 
 
264 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.09 
 
 
261 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.76 
 
 
258 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3600  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.86 
 
 
272 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>