More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3770 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3770  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
418 aa  812    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.32076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1507  major facilitator transporter  25.26 
 
 
411 aa  116  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0005  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.695547  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  26.61 
 
 
420 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3973  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
449 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1556  putative transmembrane transport protein  25.78 
 
 
422 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.233072  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
396 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1964  major facilitator transporter  27.46 
 
 
440 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0613  major facilitator superfamily transporter  26.87 
 
 
422 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0005  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
396 aa  99.8  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1850  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0039  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
420 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2824  major facilitator transporter  25.72 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2012  major facilitator transporter  26.63 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.147119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3708  major facilitator transporter  28.53 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0566  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
428 aa  87.4  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2034  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
419 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.836232  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1968  major facilitator transporter  27.34 
 
 
410 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.620228  normal  0.0550042 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1566  major facilitator transporter  27.3 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.646941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2216  major facilitator superfamily transporter  26.18 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167097 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.67 
 
 
439 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1885  major facilitator transporter  29.07 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2766  major facilitator transporter  27.57 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0083  major facilitator superfamily transporter  25.59 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4393  major facilitator transporter  26.84 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.4 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0358  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2519  major facilitator transporter  23.16 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  22.79 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3329  major facilitator transporter  25.36 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.707628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
435 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0689  major facilitator superfamily permease  25.64 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
435 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.13 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.13 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3502  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
439 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.47 
 
 
440 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2366  antibiotic MFS transporter, putative  25.25 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.89438  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2568  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
427 aa  76.3  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2084  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
395 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.942608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  26.89 
 
 
405 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  26.58 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  24.08 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  23.93 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1437  major facilitator transporter  23.08 
 
 
402 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  25.16 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2124  major facilitator superfamily transporter  27.89 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.204693  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  33.33 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3928  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0059  major facilitator transporter  34.81 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2673  major facilitator transporter  27.03 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  21.93 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3306  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1696  fosmidomycin resistance protein  24.01 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00774427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1677  fosmidomycin resistance protein  24.01 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0817289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1652  fosmidomycin resistance protein  24.01 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000459515  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  21.9 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1830  fosmidomycin resistance protein  24.01 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13070  MFS family transporter  25 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  24.5 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4717  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521537 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2522  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.636456  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3640  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1918  fosmidomycin resistance protein  22.73 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.243949  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  24.85 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.6 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  23.63 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  26.18 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  25.27 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1836  fosmidomycin resistance protein  23.1 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1953  fosmidomycin resistance protein  24.04 
 
 
403 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1874  fosmidomycin resistance protein  24.04 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  24.52 
 
 
427 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  27.43 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  27.51 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1857  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
408 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0541564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1690  major facilitator transporter  23.46 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  27.43 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  27.43 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3507  fosmidomycin resistance protein  23.4 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  27.51 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  27.43 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.54 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0055  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628299  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0645  major facilitator transporter  24.63 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.080187  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3033  fosmidomycin resistance protein  24.66 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00068897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.37 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  20.69 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  20.64 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  27.78 
 
 
431 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  25 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>