73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4667 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4667  addiction module toxin, RelE/StbE  100 
 
 		 103 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129269  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7898  addiction module toxin, RelE/StbE family  71.84 
 
 		 97 aa  146  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2089  addiction module toxin, RelE/StbE  51.96 
 
 		 100 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.36704  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3632  addiction module antitoxin  54 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3558  addiction module toxin, RelE/StbE  44 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7132  addiction module toxin, RelE/StbE family  45.92 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.307918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3231  plasmid stabilization system protein  56.32 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3762  addiction module antitoxin  43.3 
 
 		 93 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.218607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4958  addiction module antitoxin  39.18 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268337  hitchhiker  0.00026451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3518  addiction module toxin, RelE/StbE family  39.39 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2718  addiction module antitoxin  39 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3082  addiction module toxin, RelE/StbE family  37 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4779  plasmid stabilization system protein  45.57 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00246534  hitchhiker  0.00750512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3179  addiction module toxin, RelE/StbE family  40.4 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.526244  hitchhiker  0.0000000227197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4586  addiction module antitoxin  40.21 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0843  plasmid stabilization system protein  37.37 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0822  RelE/ParE family addiction module toxin  36.08 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2783  plasmid stabilization system  40.21 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.0000000825631  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6061  addiction module antitoxin  43.27 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2453  plasmid stabilization system  36.36 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1126  addiction module toxin, RelE/StbE  39.18 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000106734  unclonable  0.00000665595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0943  plasmid stabilization system  35.35 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0770859  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2606  plasmid stabilization system protein  41.11 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3843  addiction module antitoxin  43.48 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0006  YacB  39.39 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0721  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.73 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000622259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0621  addiction module antitoxin  40.62 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2238  addiction module antitoxin  38.95 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.61217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0056  plasmid stabilization system protein  34.34 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0444  plasmid stabilization system protein  40.86 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000448662  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3759  plasmid stabilization system protein  39.51 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4481  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.99 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1854  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.99 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.057882  unclonable  0.00000000000000929031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1479  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.99 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655349  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6341  'toxin of a toxin/antitoxin system, parE-like; Plasmid stabilization system protein (IncP-1beta multiresistance plasmid pB8)Addiction module toxin, RelE/StbE'  32.99 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000179089  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3677  hypothetical protein  34.02 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5982  addiction module toxin, RelE/StbE family  42.42 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4998  addiction module antitoxin  38.54 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3592  addiction module antitoxin  41.94 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1115  addiction module antitoxin  34.95 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2109  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.02 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273574  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36500  Plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_53  putative plasmid stabilization system protein  32.63 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000087371  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3590  plasmid stabilization system protein  37.23 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221708  normal  0.630587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3876  addiction module toxin, RelE/StbE family  35.37 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0144  plasmid stabilization system protein  35.64 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.930281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4398  addiction module toxin, RelE/StbE family  36.46 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.559354  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2336  addiction module toxin, RelE/StbE family  32.99 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2785  StaB  35.05 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.103046  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3250  plasmid stabilization system protein  37.37 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109346  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7598  addiction module antitoxin  33.33 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5829  addiction module toxin, RelE/StbE family  34.65 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3174  plasmid stabilization system protein  37.37 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1116  plasmid stabilization system  34.65 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0746682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02178  plasmid stabilization system protein  34.74 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0449749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1531  plasmid stabilization system protein  34.38 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03524  RelE/ParE family plasmid stabilization system protein  39.73 
 
 		 348 aa  48.9  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0057  hypothetical protein  34.02 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.8901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4067  addiction module toxin, RelE/StbE family  34 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0408  addiction module toxin, RelE/StbE family  31.63 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3170  plasmid stabilization system protein  32.99 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0573  plasmid stabilization system protein  34.83 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0309359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4989  addiction module antitoxin  31.25 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0140  addiction module antitoxin  36.36 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2915  addiction module toxin, RelE/StbE  36.36 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0140  addiction module antitoxin  35.35 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0195  plasmid stabilization system protein  32.32 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4641  hypothetical protein  34.04 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4130  plasmid stabilization system protein  28.42 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0087  plasmid stabilization system  38.67 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13720  addiction module toxin, RelE/StbE family  27.84 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000898727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4802  addiction module toxin, RelE/StbE  35.29 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.746652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3831  plasmid stabilization system protein  29.29 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>