86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5303 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 172 aa  358  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  71.24 
 
 		 183 aa  238  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  59.17 
 
 		 244 aa  197  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  53.22 
 
 		 262 aa  196  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  53.85 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  58.94 
 
 		 245 aa  191  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  52.27 
 
 		 266 aa  184  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  53.89 
 
 		 356 aa  184  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  52.07 
 
 		 266 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  59.72 
 
 		 338 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  57.64 
 
 		 251 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  45.93 
 
 		 651 aa  160  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  43 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  43.45 
 
 		 313 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  41.44 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  38.69 
 
 		 197 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  37 
 
 		 221 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  37 
 
 		 221 aa  110  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  37 
 
 		 221 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  37 
 
 		 221 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  37 
 
 		 221 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  37 
 
 		 221 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  37 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  36.55 
 
 		 221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  36.55 
 
 		 221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 221 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.34 
 
 		 491 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.84 
 
 		 491 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.89 
 
 		 481 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.89 
 
 		 481 aa  103  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  38.76 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.95 
 
 		 481 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.37 
 
 		 481 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.93 
 
 		 481 aa  98.2  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  37 
 
 		 491 aa  97.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  35.12 
 
 		 455 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  35.12 
 
 		 455 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.65 
 
 		 477 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.63 
 
 		 455 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 455 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  34.63 
 
 		 455 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  34.15 
 
 		 455 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  34.63 
 
 		 455 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.01 
 
 		 486 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  34.15 
 
 		 455 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33 
 
 		 455 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 458 aa  91.3  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  33.66 
 
 		 455 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  33.5 
 
 		 456 aa  90.9  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  33.66 
 
 		 455 aa  90.9  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  31.5 
 
 		 456 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  32.56 
 
 		 459 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  30.57 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.14 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  26.44 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  29.21 
 
 		 445 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.69 
 
 		 471 aa  75.9  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.55 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.25 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.5 
 
 		 491 aa  72  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  31.84 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.72 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  28.47 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  26.67 
 
 		 390 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  28.18 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  28.18 
 
 		 233 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  28.18 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  28.18 
 
 		 233 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  28.18 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  26.79 
 
 		 359 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  28.18 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  27.27 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  28.18 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  23.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  24.64 
 
 		 307 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  23.83 
 
 		 285 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  24.74 
 
 		 465 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  26.92 
 
 		 236 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  24.37 
 
 		 464 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  25.11 
 
 		 534 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  25.11 
 
 		 534 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  25.11 
 
 		 534 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  24.77 
 
 		 438 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  25.2 
 
 		 389 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  25.98 
 
 		 388 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>