More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5218 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  79.13 
 
 		 267 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  75 
 
 		 271 aa  384  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  70.87 
 
 		 254 aa  359  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.2 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  67.21 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  65.31 
 
 		 245 aa  322  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  63.24 
 
 		 254 aa  314  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  58.59 
 
 		 261 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  58.37 
 
 		 261 aa  301  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  57.25 
 
 		 271 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  56.92 
 
 		 295 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 277 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.81 
 
 		 261 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.37 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.48 
 
 		 261 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  57.42 
 
 		 261 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  56.64 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  52.24 
 
 		 282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  56.57 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  53.2 
 
 		 267 aa  281  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  55.2 
 
 		 254 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  54.92 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  52.16 
 
 		 265 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  49.8 
 
 		 256 aa  251  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  51.15 
 
 		 268 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  54.25 
 
 		 254 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  50.74 
 
 		 274 aa  250  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  54.29 
 
 		 245 aa  250  2e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  52.82 
 
 		 258 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  49.61 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.59 
 
 		 252 aa  249  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  50.6 
 
 		 263 aa  248  9e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.15 
 
 		 244 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  50.19 
 
 		 250 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  49.6 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  52.59 
 
 		 241 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  52.36 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  51.78 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  51.38 
 
 		 249 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  52.48 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 		 254 aa  244  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  51.95 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  50.2 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  53.09 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 256 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 240 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  52.55 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  49.21 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  54.25 
 
 		 253 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3993  ABC transporter related  50.6 
 
 		 240 aa  242  5e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  52.07 
 
 		 254 aa  242  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 		 240 aa  242  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.84 
 
 		 592 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  48.63 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  49 
 
 		 267 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  51.57 
 
 		 264 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  52.57 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4223  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00581903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  48.24 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  56.73 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  50.41 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  50.61 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4172  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.183609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  51.19 
 
 		 252 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  51.22 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 		 241 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0431  ABC transporter related  50.21 
 
 		 286 aa  239  5e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0284174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  50 
 
 		 259 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51.79 
 
 		 241 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51.79 
 
 		 241 aa  239  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  48.82 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  50.2 
 
 		 241 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  47.27 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  50 
 
 		 243 aa  238  8e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  51.82 
 
 		 242 aa  238  9e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.22 
 
 		 595 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  49.8 
 
 		 250 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 240 aa  238  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.22 
 
 		 261 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.55 
 
 		 250 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  51.79 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  49.8 
 
 		 254 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  51.79 
 
 		 240 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0814  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.02 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0857  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.02 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  50.59 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  48.85 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4987  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51 
 
 		 252 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.894547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  51.39 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>