More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3864 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3864  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
288 aa  577  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.707292 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2531  putative glycosyltransferase  81.63 
 
 
337 aa  454  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  70.1 
 
 
317 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1357  glycosyl transferase family 2  65.29 
 
 
293 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0725  family 2 glycosyl transferase  63.23 
 
 
292 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0538326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3732  glycosyltransferase-like protein  50 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  0.0274925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3343  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
318 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178674  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
305 aa  79  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  24.7 
 
 
338 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  29.44 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1377  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.750548  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6452  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6044  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
359 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.52 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3812  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4889  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0764718 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
841 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6392  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863517  normal  0.0945582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
822 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
337 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
346 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
345 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
325 aa  62.8  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 
337 aa  62.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
315 aa  62.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5252  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 
327 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
335 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.74 
 
 
322 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0072  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
341 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.6 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  23.43 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  32.26 
 
 
292 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
350 aa  60.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  26.83 
 
 
838 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1306  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.35 
 
 
358 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  42.5 
 
 
366 aa  59.7  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
352 aa  59.7  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
326 aa  59.3  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3595  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
331 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
337 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1342  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
353 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
316 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  25.58 
 
 
330 aa  59.3  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.91 
 
 
754 aa  58.9  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
340 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1579  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.034375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  30.6 
 
 
264 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  22.26 
 
 
321 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
513 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  21.12 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
1077 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  26.89 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1323  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  23.38 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  23.38 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1617  family 2 glycosyl transferase  30.21 
 
 
292 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0602  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
282 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000299087  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
307 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  24.79 
 
 
339 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.18 
 
 
411 aa  56.6  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2652  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
372 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.689444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
337 aa  55.8  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  26.25 
 
 
348 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
281 aa  55.8  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  24.79 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.22 
 
 
379 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6429  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596703  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  26.56 
 
 
352 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  27.54 
 
 
1118 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1912  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
342 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
315 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  23.24 
 
 
924 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>