149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3511 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3511  PfkB domain protein  100 
 
 
306 aa  607  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.280812  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4369  PfkB domain-containing protein  56.29 
 
 
307 aa  315  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3352  ribokinase family sugar kinase  50.68 
 
 
303 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.38232  decreased coverage  0.00309735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2113  PfkB domain protein  50.9 
 
 
304 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4175  ribokinase-like domain-containing protein  45.42 
 
 
316 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09710  PfkB domain protein  29.15 
 
 
305 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1114  PfkB domain protein  34.63 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  32.13 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1951  PfkB  28.91 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.194411  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  27.86 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  27.48 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  27.48 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  27.48 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  27.48 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  27.48 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  27.48 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  30.37 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0148  ribokinase-like domain-containing protein  24.11 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0711  carbohydrate kinase  23.22 
 
 
328 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1009  PfkB domain protein  30.14 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0646  ribokinase-like domain-containing protein  23.74 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_618  sugar kinase ribokinase  24.15 
 
 
328 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0660  ribokinase family sugar kinase  26.45 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0298925  normal  0.606106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  28.83 
 
 
320 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  21.23 
 
 
302 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  20.79 
 
 
302 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  29.02 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  28.57 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  25.17 
 
 
299 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  23.95 
 
 
670 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  24.67 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  28.46 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  24.66 
 
 
680 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  20.19 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  28.36 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  28.52 
 
 
299 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  26.56 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  28.41 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  21.48 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  30.36 
 
 
296 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  27.99 
 
 
300 aa  53.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  23.63 
 
 
681 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  35.48 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.85 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  24.61 
 
 
313 aa  52.8  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  24.09 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  25.64 
 
 
309 aa  52.8  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  24.09 
 
 
315 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  27.36 
 
 
318 aa  52  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  23.26 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0911  PfkB domain protein  26.97 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  27.07 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0885  PfkB domain protein  26.97 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  29 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  29.22 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  27.94 
 
 
297 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  29.43 
 
 
323 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1355  ribokinase family sugar kinase  23.94 
 
 
224 aa  49.7  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  25.93 
 
 
304 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  21.9 
 
 
312 aa  49.3  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  27.66 
 
 
311 aa  49.3  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0259  PfkB domain protein  32.17 
 
 
310 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  30.59 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  28.74 
 
 
303 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  25.77 
 
 
316 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  36.05 
 
 
324 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.21 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  26.3 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  32.65 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  25.5 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  22.26 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  22.92 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  31.01 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  26.07 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  24.9 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  23.03 
 
 
652 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  25.8 
 
 
317 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  25.5 
 
 
666 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  25.5 
 
 
666 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  25.5 
 
 
666 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  25.5 
 
 
666 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  25.5 
 
 
666 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  25.5 
 
 
666 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  25.5 
 
 
666 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  24.48 
 
 
314 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  25.77 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.08 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  35.94 
 
 
372 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  35.94 
 
 
372 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  25.83 
 
 
322 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2117  PfkB domain protein  31.97 
 
 
338 aa  46.2  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.496872  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  29.13 
 
 
307 aa  46.2  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  45.28 
 
 
342 aa  45.8  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  30.17 
 
 
326 aa  46.2  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  25 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  25.7 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  29.55 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  33.33 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  27.39 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>