More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2838 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  100 
 
 		 299 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  88.81 
 
 		 297 aa  557  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  87.21 
 
 		 300 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  87.12 
 
 		 318 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  85.08 
 
 		 297 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  29.39 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  32.99 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.85 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  28.12 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  31.1 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  30.72 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  31.1 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  32.54 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  25.68 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  26.64 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  26.25 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  25.45 
 
 		 286 aa  92  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  26.44 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  28.52 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  28.95 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  27.18 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  29.18 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  29.78 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  29.04 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  29.04 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  29.04 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  29.04 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  31.33 
 
 		 324 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  29.04 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  30.77 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  30.77 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  30.77 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  30.77 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  30.77 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  28.05 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  22.71 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  30.69 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  30.35 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  28.66 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  24.52 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  30.31 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  27.63 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  22.08 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  28.57 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  22.29 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  22.84 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  24.59 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1888  PfkB  26.36 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.389987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  27.91 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  23.99 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  26.74 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  25.7 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  21.86 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  26.96 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  26.96 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  22.85 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  24.2 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  24.42 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  22.92 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  22.92 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  22.92 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  22.92 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  23.38 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  22.92 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  21.73 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  23.32 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  22.78 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  23.51 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  29.32 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  22.59 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  22.59 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  26.62 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  25.28 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  25.28 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  24.16 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  28.75 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  35 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  27.69 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  23.7 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  23.13 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  23.08 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.24 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  21.45 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  22.59 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  25.58 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  21.59 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  24.9 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  25.64 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  26.99 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  24.83 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  26.99 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  24.6 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  22.41 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  20.07 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  22.19 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  25.38 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  24.64 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  26.45 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>