More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1940 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1940  PfkB  100 
 
 
294 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  63.96 
 
 
286 aa  384  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  64.64 
 
 
288 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  57.09 
 
 
291 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  57.09 
 
 
291 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  59.42 
 
 
285 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  36.21 
 
 
311 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  33.8 
 
 
288 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  35.34 
 
 
284 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  35.38 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1248  PfkB domain protein  33.44 
 
 
310 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000612898  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  35.34 
 
 
296 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  31.16 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 
298 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0378  PfkB domain protein  32.41 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  28.11 
 
 
300 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  28.12 
 
 
299 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  26.91 
 
 
318 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  27.71 
 
 
297 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  26.1 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  27.62 
 
 
324 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  23.94 
 
 
304 aa  92.8  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  27.54 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  27.54 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  27.54 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  27.54 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  27.54 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  27.54 
 
 
298 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  26.48 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 
300 aa  88.2  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
310 aa  85.5  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  26.32 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  27.62 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  25.65 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  24.64 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  26.36 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  23.93 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  25.72 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  25.72 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  25.54 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  25.72 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  25.72 
 
 
298 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.63 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  27.05 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  25.36 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  22.46 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  25.8 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  25.45 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  23.02 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  25.19 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  27.08 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  24.42 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  22.14 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  24.63 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  22.66 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  25 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  22.02 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  24.81 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  25.28 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  25.28 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  25.28 
 
 
285 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  25 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  22.38 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  22.02 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  23.88 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  22.02 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  22.38 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  22.38 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  22.38 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  22.02 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  25.91 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  22.71 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  20.67 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  23.22 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  22.07 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  23.69 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  23.21 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1802  ribokinase family sugar kinase  26.05 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00331295  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  24.65 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  22.4 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  22.97 
 
 
403 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  22.82 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  22.82 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  22.82 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  21.85 
 
 
398 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  22.82 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  22.82 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  22.4 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  22.4 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  22.35 
 
 
297 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  19.67 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  25.67 
 
 
304 aa  62.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  22.65 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  22.42 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0118  ribokinase  25.61 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  22.63 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  22.81 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  20.85 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>