267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6930 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  100 
 
 		 313 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  41.75 
 
 		 288 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  47.84 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  29.07 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  29.47 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  28.98 
 
 		 285 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  38.11 
 
 		 284 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  39.75 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  27.05 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  32.68 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0378  PfkB domain protein  37.06 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  25.54 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  40.45 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1248  PfkB domain protein  33.1 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000612898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  29.51 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  25.71 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  27.67 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  30.99 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  32.91 
 
 		 284 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  28.81 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  26.71 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  25.15 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  32.9 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3749  ribokinase  21.18 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3738  ribokinase  21.18 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3859  ribokinase  21.18 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3816  ribokinase  21.18 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3918  ribokinase  21.18 
 
 		 404 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36053  predicted protein  33.16 
 
 		 393 aa  68.9  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.630596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  21.14 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  27.78 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  23.82 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  28.99 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  27.33 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  27.65 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  23.03 
 
 		 403 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.21 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  25.48 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  29.24 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  29.24 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  29.24 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  29.24 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  29.39 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  29.24 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  21.82 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.38 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  29.96 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  26.79 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  26.69 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  29.84 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  28.15 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  24.21 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  25.15 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  27.05 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  28.57 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  22.99 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  31.61 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.89 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  28.38 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  28.38 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  28.38 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  28.38 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  29.8 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  32.5 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  26.74 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  25.62 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  24.63 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  27.37 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  24.33 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  31.25 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  27.72 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  27.15 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  27.15 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  27.37 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  30.67 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  26.46 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  27.06 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  30.55 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  26.46 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  26.59 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  23.41 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0005  ribokinase, putative  27.83 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0831175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1818  ribokinase-like domain-containing protein  21.39 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.72818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  27.02 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  29.06 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  26.05 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  27.02 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  26.28 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  25.5 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  26.32 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  29.41 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  30 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  31.56 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  25.86 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  26.52 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>