289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0378 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0378  PfkB domain protein  100 
 
 
301 aa  566  1e-160  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  47.51 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1248  PfkB domain protein  43.57 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000612898  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  50.17 
 
 
296 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  35.17 
 
 
286 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  29.86 
 
 
291 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  29.86 
 
 
291 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  43.84 
 
 
284 aa  149  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  42.16 
 
 
311 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  31.31 
 
 
288 aa  143  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  30.48 
 
 
285 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  32.41 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  43.09 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  36.74 
 
 
313 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  38.86 
 
 
453 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  31.67 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  31.72 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  31.33 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.574224 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  31.33 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  31.33 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  31.33 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  31.33 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  30.53 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  30.93 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  30.58 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  30.97 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  27.04 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  31.01 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  29.47 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3080  kinase, PfkB family  26.71 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0595039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  27.65 
 
 
424 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  29.57 
 
 
298 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  29.57 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  28.66 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  29.57 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  29.57 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  29.57 
 
 
298 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  28.36 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  28.71 
 
 
310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  29.86 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  28.23 
 
 
292 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  29.39 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  26.71 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  24.65 
 
 
398 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  27.94 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  28.62 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  27.94 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  29.5 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  21.13 
 
 
306 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  26.89 
 
 
299 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  32.24 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  28.31 
 
 
298 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  30.88 
 
 
299 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  28.31 
 
 
298 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  27.45 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  27.94 
 
 
298 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2287  kinase, PfkB family  26.28 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  27.94 
 
 
298 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2380  kinase, PfkB family  27.61 
 
 
321 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.511168  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  27.84 
 
 
298 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2331  kinase PfkB family  27.61 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2488  PfkB family kinase  27.61 
 
 
321 aa  59.3  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  27.94 
 
 
298 aa  58.9  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  31.16 
 
 
312 aa  58.9  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  29.76 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  27.94 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  28.43 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  40.22 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.36 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  25.67 
 
 
299 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  29.04 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  26.69 
 
 
313 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  29.04 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  26.3 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2376  kinase, PfkB family  26.28 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15593  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.35 
 
 
304 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  28.03 
 
 
309 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  25.17 
 
 
403 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  24.76 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  26.85 
 
 
321 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  31.06 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  28.34 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  30.1 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  26.3 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1001  PfkB domain protein  28.96 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  25.94 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  25 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  31.4 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  25.17 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  24.66 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3090  PfkB  26.43 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133749  normal  0.247414 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  25.99 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  29.88 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  30.67 
 
 
311 aa  53.9  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  26.56 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  31.01 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  32.52 
 
 
326 aa  54.3  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0987  ribokinase  24.23 
 
 
293 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.135221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>