40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5931 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  865    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  41.03 
 
 		 288 aa  159  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  39.49 
 
 		 286 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  35.86 
 
 		 291 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  35.53 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  38.14 
 
 		 285 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  35.38 
 
 		 294 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  42.15 
 
 		 296 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0378  PfkB domain protein  38.99 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  35.74 
 
 		 311 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  42.01 
 
 		 301 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1248  PfkB domain protein  32.23 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000612898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  37.31 
 
 		 288 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  37.55 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  33.13 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  34.59 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  32.16 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  37.5 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  35.06 
 
 		 2914 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.53 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 304 aa  57  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  29.28 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  29.48 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  35 
 
 		 300 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  35 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  31.66 
 
 		 326 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  35 
 
 		 297 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  33.77 
 
 		 2851 aa  52.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  28.92 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  29.52 
 
 		 284 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  28.35 
 
 		 313 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  30 
 
 		 312 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  30.35 
 
 		 290 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  32.75 
 
 		 310 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  31.69 
 
 		 299 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  38.2 
 
 		 309 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  40.51 
 
 		 314 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  41.18 
 
 		 299 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>