89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1248 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1248  PfkB domain protein  100 
 
 		 310 aa  601  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000612898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0378  PfkB domain protein  43.57 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  35.02 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  34.55 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  34.88 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  35.48 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  33.33 
 
 		 294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  33.44 
 
 		 288 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  38.13 
 
 		 288 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  38.41 
 
 		 311 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  37.87 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  39.13 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  36.7 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  32.76 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  33.18 
 
 		 453 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  30.03 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  27.78 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  30.12 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  29.14 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  24.84 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  26.97 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  25.86 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  25 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  25.97 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  25.63 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  24.91 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1363  ribokinase-like domain-containing protein  27.07 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  25 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  25 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  22.48 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  27.31 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  27.1 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  25.76 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  26.72 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  26.37 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  25.1 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  24.54 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  23.23 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  24.84 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  27.03 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  28.63 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  25.46 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  24.56 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  25.36 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  26.94 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  27.44 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  26.94 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  24.77 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  22.91 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  24.91 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  23.79 
 
 		 398 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  24.92 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  25.53 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  25.37 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  25.53 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  22.43 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  24.28 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  22.34 
 
 		 403 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  26.56 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  31.3 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  25.67 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3196  ribokinase  32.46 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.20247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  20.82 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  23.62 
 
 		 297 aa  45.8  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1183  ribokinase  25.72 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  34.67 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  26.2 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1257  ribokinase  25.72 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2471  ribokinase  22.1 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1627  ribokinase  24.43 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  22.63 
 
 		 424 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  20.38 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  23.97 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36053  predicted protein  24.04 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.630596  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  23.97 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  24.42 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  25.19 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  26.13 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1554  ribokinase  23.94 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  27.94 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  26.83 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1858  ribokinase  23.28 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  24.51 
 
 		 307 aa  42.7  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  25.93 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1871  ribokinase  23.28 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.215166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2236  PfkB family kinase  26.87 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2389  PfkB family kinase  26.87 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  20.8 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>