More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3129 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  100 
 
 
315 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  67.73 
 
 
315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  60.83 
 
 
315 aa  350  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  56.05 
 
 
352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  59.87 
 
 
314 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  55.06 
 
 
342 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  58.47 
 
 
323 aa  317  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  55.1 
 
 
313 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  55.1 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  48.26 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  53.65 
 
 
361 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  53.82 
 
 
363 aa  281  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  53.5 
 
 
312 aa  278  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  52.35 
 
 
360 aa  275  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  49.21 
 
 
315 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  52.56 
 
 
363 aa  268  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  50.64 
 
 
312 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  48.73 
 
 
314 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  48.57 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  47.77 
 
 
313 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  50.32 
 
 
314 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  52.68 
 
 
330 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  48.09 
 
 
313 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  49.68 
 
 
315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  48.87 
 
 
320 aa  242  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  47.13 
 
 
325 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  49.68 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  49.04 
 
 
329 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  42.32 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  45.71 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  43.67 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  45.74 
 
 
335 aa  210  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  42.3 
 
 
314 aa  208  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  36.94 
 
 
312 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  43.99 
 
 
354 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  37.78 
 
 
312 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  44.3 
 
 
319 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  37.85 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  34.98 
 
 
320 aa  182  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  37.85 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  36.45 
 
 
322 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  39.37 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  35.03 
 
 
323 aa  169  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  34.28 
 
 
315 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  34.28 
 
 
315 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  36.14 
 
 
317 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  39.37 
 
 
340 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  36.08 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  41.72 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  34.07 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  35.14 
 
 
321 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  34.19 
 
 
319 aa  162  9e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  36.28 
 
 
323 aa  160  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  37.74 
 
 
321 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  34.37 
 
 
316 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  38.41 
 
 
332 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  37.62 
 
 
321 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  40.95 
 
 
313 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  37.42 
 
 
317 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  35.4 
 
 
327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  35.83 
 
 
327 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  29.55 
 
 
313 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  35.14 
 
 
297 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  35.14 
 
 
297 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  37.06 
 
 
315 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  36.83 
 
 
321 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  35.51 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  35.51 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  35.51 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  35.51 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  35.51 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  35.51 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  35.51 
 
 
327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  35.58 
 
 
300 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.38 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  33.33 
 
 
298 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  36.98 
 
 
306 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  39.25 
 
 
312 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.55 
 
 
316 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  34.89 
 
 
327 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  34.89 
 
 
327 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  35.66 
 
 
322 aa  149  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  34.06 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.74 
 
 
315 aa  147  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  34.17 
 
 
335 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.9 
 
 
400 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  30.57 
 
 
325 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  34.05 
 
 
336 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  36.09 
 
 
307 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  34.29 
 
 
311 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.81 
 
 
316 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  37.93 
 
 
320 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  37.93 
 
 
320 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  38.56 
 
 
318 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  35.03 
 
 
325 aa  142  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  33.97 
 
 
302 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  36.28 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  33.2 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  37.66 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.56 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>