More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2625 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 295 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  46.32 
 
 		 290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  46.32 
 
 		 290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1740  transcriptional regulator, GntR family  43.57 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000284043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 268 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.14 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 248 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 240 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.51 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 249 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  31.52 
 
 		 248 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.47 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 258 aa  95.5  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.05 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 256 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 255 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0887  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  93.6  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 247 aa  93.6  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  31.71 
 
 		 246 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 245 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 246 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.84 
 
 		 255 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 245 aa  92  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.98 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  29.18 
 
 		 239 aa  92  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.64 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 248 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 243 aa  90.1  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 263 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.13 
 
 		 256 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0574  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 253 aa  89  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.391885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.94 
 
 		 272 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4176  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 245 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  25.52 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  32.64 
 
 		 247 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0266  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.75 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2893  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.83 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  23.64 
 
 		 245 aa  85.9  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 246 aa  85.9  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.56 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2299  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  26.7 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  25.51 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1176  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  29.41 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2399  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.720862  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2585  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  29.41 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0315  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  29.41 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2332  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>