186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1748 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 208 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  43.63 
 
 		 209 aa  158  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  47.29 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  39.23 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  38.97 
 
 		 217 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  37.91 
 
 		 239 aa  95.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  35.47 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  36.45 
 
 		 210 aa  89.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 235 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 215 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  26.96 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  38.01 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 147 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  28.21 
 
 		 146 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  35.62 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 146 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 		 133 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 137 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 139 aa  52.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  47.06 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 144 aa  52  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.62 
 
 		 156 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 		 133 aa  52  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 149 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 132 aa  51.6  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  30.34 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  32.14 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  30.67 
 
 		 144 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 138 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 136 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 140 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 140 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 139 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 143 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 143 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  32.5 
 
 		 152 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.65 
 
 		 147 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 146 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 141 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  29.79 
 
 		 132 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 140 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 146 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  29.33 
 
 		 144 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 249 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 320 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  32.32 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  25.64 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 142 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  32.14 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 133 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1034  SoxR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 137 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 140 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  28.92 
 
 		 148 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.5 
 
 		 142 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 172 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  29.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  32.88 
 
 		 132 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>