211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1333 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  85.25 
 
 		 279 aa  489  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  73.74 
 
 		 279 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  72.89 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  74.45 
 
 		 280 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  74.45 
 
 		 280 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  73.38 
 
 		 300 aa  381  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  58.76 
 
 		 272 aa  315  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  56.57 
 
 		 279 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  56.68 
 
 		 286 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 289 aa  278  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  52.22 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  51.44 
 
 		 280 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  53.41 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  48.2 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  46.18 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  47.08 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 287 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  42.65 
 
 		 292 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  45.13 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  40.15 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  38.25 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  36.33 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  36.92 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  36.88 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  36.4 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  37.59 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  36.69 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  36.8 
 
 		 326 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  37.37 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 282 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  36.3 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  37.46 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  34.17 
 
 		 309 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  33.69 
 
 		 317 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  35.21 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  34.89 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  36.33 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  37.28 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  37.28 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  35.45 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  33.96 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  34.62 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  34.09 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  34.17 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  35.77 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  35.64 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  35.66 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  35.25 
 
 		 298 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  34.98 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  35.93 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  33.7 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  29.15 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  35.53 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  34.38 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  32.75 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.17 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 299 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  33.7 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  34.38 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 283 aa  112  8.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1431  XRE family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  32.06 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  31.56 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  36.98 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  31.52 
 
 		 307 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 305 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  30.99 
 
 		 303 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  32.28 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  32.37 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  35.8 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  33.21 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>