More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0624 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  100 
 
 		 394 aa  756    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  54.61 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  42.82 
 
 		 443 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  43.13 
 
 		 457 aa  249  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  38.7 
 
 		 435 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  37.68 
 
 		 476 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  39.07 
 
 		 449 aa  212  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  34.76 
 
 		 449 aa  209  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  36.32 
 
 		 450 aa  209  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  33.81 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  34.05 
 
 		 455 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  32.46 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  32.7 
 
 		 447 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  34.67 
 
 		 446 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  35.12 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  34.69 
 
 		 442 aa  180  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  30.68 
 
 		 448 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  35.46 
 
 		 468 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  40.65 
 
 		 569 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  36.67 
 
 		 473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  35.41 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  31.68 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  27.8 
 
 		 453 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  27.8 
 
 		 453 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  27.8 
 
 		 453 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  27.8 
 
 		 453 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  29.61 
 
 		 473 aa  143  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  26.45 
 
 		 458 aa  142  7e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  27.57 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  27.34 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  27.34 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  27.34 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  29.74 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  26.87 
 
 		 453 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  26.64 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  26.4 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  26.82 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  30.81 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  29.38 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.87 
 
 		 454 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  28.3 
 
 		 461 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  27.61 
 
 		 449 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.87 
 
 		 494 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.4 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4066  dihydropyrimidinase  31.94 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  26.18 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  27.69 
 
 		 471 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  29.31 
 
 		 458 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  32.95 
 
 		 579 aa  113  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.1 
 
 		 423 aa  113  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0931  dihydropyrimidinase  28.77 
 
 		 464 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.303478 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.84 
 
 		 437 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.23 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  32.08 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  29.27 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.39 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  29.38 
 
 		 570 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  26.49 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.18 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  30.81 
 
 		 454 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  26.47 
 
 		 469 aa  106  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  29.74 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  31.34 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  29.05 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  27.36 
 
 		 477 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  26.28 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.53 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.65 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  25.83 
 
 		 444 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  30.15 
 
 		 449 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  26.22 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  32.08 
 
 		 454 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  25.88 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  25.88 
 
 		 444 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  26.26 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.87 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.74 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  28.18 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  27.19 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0732  dihydropyrimidinase  25.73 
 
 		 479 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  26.48 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  29.31 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  30.36 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  26.77 
 
 		 471 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  26.77 
 
 		 472 aa  99.4  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  26.77 
 
 		 471 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.82 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  28.88 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  25.45 
 
 		 467 aa  99  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  25.53 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  27.54 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  30.31 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.48 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  31.23 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.08 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  26.63 
 
 		 459 aa  97.4  4e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.27 
 
 		 438 aa  97.1  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  30.79 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  28.82 
 
 		 436 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  27.05 
 
 		 443 aa  96.3  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>