More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5405 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  71.06 
 
 		 446 aa  642    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 446 aa  905    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  69.18 
 
 		 438 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  66.97 
 
 		 439 aa  600  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  67.91 
 
 		 437 aa  597  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  65.02 
 
 		 436 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  62.33 
 
 		 441 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  64.2 
 
 		 438 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  63.15 
 
 		 430 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 441 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  65.38 
 
 		 611 aa  544  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  57.77 
 
 		 440 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  60.7 
 
 		 436 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  61.98 
 
 		 454 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  58.58 
 
 		 437 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  58.26 
 
 		 437 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  60.69 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  60.64 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  56.47 
 
 		 440 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  55.05 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  53.6 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  52.63 
 
 		 433 aa  438  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  42.62 
 
 		 432 aa  365  1e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  43 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  41.77 
 
 		 416 aa  330  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19970  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  42.78 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0953258  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 409 aa  309  6.999999999999999e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 395 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  38.54 
 
 		 400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 383 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 403 aa  299  5e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 395 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  41.16 
 
 		 399 aa  293  4e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 399 aa  288  2e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  41.08 
 
 		 426 aa  285  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 450 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 398 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  38.96 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4437  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  37.34 
 
 		 398 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 411 aa  272  7e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  36.5 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  39.73 
 
 		 406 aa  272  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  41.94 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  36.34 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  36.34 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 		 398 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 397 aa  269  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  37.32 
 
 		 417 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  37.76 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.77 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 393 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.9 
 
 		 393 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0745  putative transcriptional regulator, GntR family  39.05 
 
 		 416 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.64 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 397 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 408 aa  264  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 410 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.76 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 401 aa  263  6.999999999999999e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  37.06 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 426 aa  262  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 393 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 393 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 393 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 377 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 340 aa  260  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  39.06 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.01 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.01 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.01 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  37.06 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.01 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.01 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  34.9 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.01 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  38.25 
 
 		 410 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3125  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 393 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  38.25 
 
 		 410 aa  257  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>