72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5063 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3413  Spermidine synthase-like protein  59.51 
 
 		 681 aa  731    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.730337  normal  0.555353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5063  Spermidine synthase-like protein  100 
 
 		 692 aa  1379    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2865  hypothetical protein  32.91 
 
 		 819 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0368958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0793  hypothetical protein  24.03 
 
 		 827 aa  70.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.526313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4279  hypothetical protein  31.85 
 
 		 818 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0150  spermidine synthase-like  32.84 
 
 		 812 aa  67.4  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2430  Spermine synthase  29.05 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.514854  hitchhiker  0.00202916 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  31.67 
 
 		 304 aa  60.1  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2931  hypothetical protein  29.63 
 
 		 766 aa  57.4  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0187375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0936  Spermine synthase  23.94 
 
 		 516 aa  55.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4224  hypothetical protein  22.22 
 
 		 821 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.965892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  30.83 
 
 		 283 aa  53.9  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  30.83 
 
 		 283 aa  53.9  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0453  hypothetical protein  26.03 
 
 		 828 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  29.75 
 
 		 286 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  29.75 
 
 		 291 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  29.75 
 
 		 286 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  28.93 
 
 		 286 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  27.27 
 
 		 286 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  29.51 
 
 		 287 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  29.27 
 
 		 279 aa  53.1  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  30.08 
 
 		 286 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  28.93 
 
 		 287 aa  50.8  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  26.71 
 
 		 283 aa  50.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3843  spermidine synthase-like protein  25.58 
 
 		 544 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  26.03 
 
 		 279 aa  49.7  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24640  spermidine synthase  34.04 
 
 		 283 aa  49.3  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.845245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  25.43 
 
 		 235 aa  49.3  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  30.6 
 
 		 302 aa  48.9  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  28.69 
 
 		 296 aa  48.9  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  28.69 
 
 		 296 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  28.69 
 
 		 296 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  30.58 
 
 		 284 aa  48.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2180  hypothetical protein  24.24 
 
 		 889 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.786018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0540  Spermine synthase  25.87 
 
 		 782 aa  47.8  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  30.33 
 
 		 286 aa  47.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2502  spermine/spermidine synthase family protein  23.3 
 
 		 1017 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0583  spermine synthase  30.41 
 
 		 837 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  31.71 
 
 		 326 aa  46.6  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  27.61 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  28.21 
 
 		 304 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  28.1 
 
 		 287 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  27.61 
 
 		 286 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  27.61 
 
 		 286 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  27.61 
 
 		 286 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  27.61 
 
 		 286 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  27.61 
 
 		 286 aa  45.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5656  Spermine synthase  28.21 
 
 		 281 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  27.05 
 
 		 276 aa  45.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  26.67 
 
 		 301 aa  45.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1032  spermine synthase  27.59 
 
 		 1040 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3160  Spermine synthase  24.73 
 
 		 982 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  27.87 
 
 		 288 aa  44.7  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0266  Spermine synthase  26.42 
 
 		 749 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  29.13 
 
 		 280 aa  44.7  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  28.1 
 
 		 287 aa  44.7  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0842  Spermine synthase  22.19 
 
 		 541 aa  44.3  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1994  spermidine synthase  28.81 
 
 		 757 aa  44.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  30.58 
 
 		 286 aa  44.3  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  32.58 
 
 		 313 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  27.87 
 
 		 288 aa  43.9  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  27.87 
 
 		 288 aa  43.9  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  27.87 
 
 		 288 aa  43.9  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  27.87 
 
 		 288 aa  43.9  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  27.87 
 
 		 288 aa  43.9  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  27.87 
 
 		 288 aa  43.9  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  29.66 
 
 		 283 aa  44.3  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  27.87 
 
 		 288 aa  43.9  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  27.87 
 
 		 288 aa  43.9  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  28.57 
 
 		 1078 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  29.13 
 
 		 280 aa  43.9  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  26.17 
 
 		 308 aa  43.9  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>