More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3362 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3362  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 425 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000110111  normal  0.0175779 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  47.75 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  45.83 
 
 		 474 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19720  predicted glycosyltransferase  46.64 
 
 		 461 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 684 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0635  family 2 glycosyl transferase  30.29 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2004  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2399  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4583  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 		 547 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.474593  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2051  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2271  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 555 aa  73.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.464934  normal  0.787256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 272 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  21.1 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.34 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  35.25 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 		 303 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 259 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  22.69 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0331  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  32.08 
 
 		 664 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  29.82 
 
 		 838 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2457  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0619  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5475  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 313 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25.49 
 
 		 700 aa  62.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1639  glycosyltransferase  28.74 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0247  putative glycosyl transferase  28.85 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0176  putative glycosyl transferase  28.85 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1186  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 305 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 		 691 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 691 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.69 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  27.72 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 		 1077 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  25 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 683 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  26.1 
 
 		 691 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1277  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  22.62 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 785 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1152  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  21.92 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000783621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  23.63 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.23 
 
 		 2401 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 841 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0479  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4197  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 352 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2075  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 303 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00350475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  32.09 
 
 		 1157 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.17 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.69 
 
 		 752 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  25.8 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 		 841 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 305 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3392  glycosyl transferase, family 2  24.24 
 
 		 303 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0282022  hitchhiker  0.0000000856485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 742 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  29 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1645  glycosyltransferase-like protein  30.34 
 
 		 573 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  29.36 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 333 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 742 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 270 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.5 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26670  hypothetical protein  29.17 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.873023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  26.16 
 
 		 312 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 836 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  28.79 
 
 		 323 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5002  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 786 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000902541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 635 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3699  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 263 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>