73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2159 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2159  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 231 aa  437  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00343469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3891  hypothetical protein  52.75 
 
 		 113 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131978  normal  0.0356458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06460  sec-independent translocase  36.64 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1860  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.15 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0887  sec-independent translocase  31.01 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0281514  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3991  sec-independent translocase  43.84 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4065  sec-independent translocase  43.84 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4005  sec-independent translocase  43.84 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.13737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0798  sec-independent translocase  34.69 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612385  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2203  sec-independent translocase  41.1 
 
 		 141 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.873436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3829  sec-independent translocase  32.26 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565106  normal  0.0266894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4493  sec-independent translocase  39.73 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152495  normal  0.0793539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1070  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.63 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.684223  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1126  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  32.65 
 
 		 120 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0776102  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0706  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  31.03 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3225  peptidyl-tRNA hydrolase  35.37 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.49 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.77 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11248  sec-independent translocase  45.1 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0984178  hitchhiker  0.00266671 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15360  twin arginine-targeting protein translocase TatB  30.13 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2763  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.62 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.02538  normal  0.128057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8412  Sec-independent protein secretion pathway components-like protein  33.33 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2184  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.39 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.427852  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2486  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.42 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713798  normal  0.019801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2513  hypothetical protein  26.8 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3012  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.29 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.706608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  25.99 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  25.99 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  25.99 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  25.99 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  25.99 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  25.99 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  25.99 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  25.99 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.06 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  25.99 
 
 		 171 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25870  hypothetical protein  28.12 
 
 		 167 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1772  twin-arginine translocation protein TatB  36.62 
 
 		 150 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4052  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.14 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3400  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.05 
 
 		 153 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0118  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.4 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  37.88 
 
 		 159 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  32.58 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2918  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  31 
 
 		 127 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0437928  normal  0.0202972 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1444  sec-independent translocase  31.18 
 
 		 112 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.608572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3709  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.71 
 
 		 153 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.237355  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1618  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.33 
 
 		 152 aa  52  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0925556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  33.63 
 
 		 916 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  29.89 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0439  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  28.57 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0551214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3956  sec-independent translocase  35.19 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  30.43 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  25.58 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  25.58 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  25.58 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  25.58 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  31.08 
 
 		 182 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4078  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  27.84 
 
 		 102 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.792853 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  45.61 
 
 		 1281 aa  48.9  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1165  sec-independent translocase  32.99 
 
 		 222 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.188357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  39.66 
 
 		 125 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7939  sec-independent translocase  30.26 
 
 		 143 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  31.4 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0381  sec-independent translocase  25.84 
 
 		 105 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2704  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  33.72 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1154  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  34.83 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184367  hitchhiker  0.00921719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0983  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  27.08 
 
 		 128 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0814  sec-independent translocase  32.29 
 
 		 141 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1686  sec-independent translocase  29.9 
 
 		 203 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  38.75 
 
 		 96 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1488  sec-independent translocase  28.87 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0660  hypothetical protein  31.63 
 
 		 138 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.329922  hitchhiker  0.00670582 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  28.57 
 
 		 1348 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>