30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48146 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  100 
 
 		 1348 aa  2778    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49448  predicted protein  25.07 
 
 		 270 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0291569  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01075  RING finger ubiquitin ligase (Tul1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12080)  29.23 
 
 		 807 aa  107  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0263562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08310  ligase, putative  28.72 
 
 		 883 aa  96.7  3e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  39.58 
 
 		 534 aa  57  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46942  predicted protein  51.43 
 
 		 788 aa  57.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  45.1 
 
 		 531 aa  57.4  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  36.73 
 
 		 611 aa  54.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  40 
 
 		 397 aa  52  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  42.22 
 
 		 439 aa  51.6  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  36.73 
 
 		 637 aa  51.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  40.43 
 
 		 831 aa  50.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  32.1 
 
 		 1086 aa  50.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  40 
 
 		 632 aa  49.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36079  predicted protein  24.77 
 
 		 565 aa  48.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  32.1 
 
 		 806 aa  48.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  33.77 
 
 		 442 aa  48.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  50 
 
 		 724 aa  48.5  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29739  predicted protein  34 
 
 		 59 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.462514  normal  0.0294486 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  38.78 
 
 		 403 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  40.38 
 
 		 531 aa  48.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27170  predicted protein  34 
 
 		 59 aa  47.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.839995 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  28.28 
 
 		 407 aa  47.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  39.58 
 
 		 537 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 1025 aa  46.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  37.78 
 
 		 334 aa  45.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93376  predicted protein  40.82 
 
 		 674 aa  45.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02070  cytoplasm protein, putative  38.78 
 
 		 712 aa  45.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3591  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  32.5 
 
 		 159 aa  45.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.733353 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  36.36 
 
 		 317 aa  45.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>