41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38016 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  100 
 
 
442 aa  915    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  25.74 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  26.91 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  39.06 
 
 
67 aa  57  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45305  predicted protein  33.72 
 
 
203 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34003  predicted protein  39.71 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29935  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  45.45 
 
 
376 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  48.89 
 
 
551 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47753  predicted protein  34.72 
 
 
700 aa  50.4  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  37.25 
 
 
222 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  28.33 
 
 
637 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  38.3 
 
 
537 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  30.88 
 
 
231 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  44.68 
 
 
616 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  37.7 
 
 
238 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  36.17 
 
 
334 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  35.9 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  33.33 
 
 
317 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  31.87 
 
 
740 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  41.3 
 
 
812 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  25.93 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  39.13 
 
 
1348 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  33.33 
 
 
831 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  40.91 
 
 
166 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  39.68 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26278  predicted protein  34.92 
 
 
103 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.063384 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  40.48 
 
 
439 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  27.37 
 
 
775 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37967  predicted protein  34.92 
 
 
220 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
1025 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  30.77 
 
 
127 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
534 aa  45.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  45.28 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  29.41 
 
 
568 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  32.39 
 
 
611 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 
559 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  37.78 
 
 
531 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119493  RING-box protein 1  31.15 
 
 
110 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0313077  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_19381  predicted protein  42.22 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.797995  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05845  RING-finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14845)  40 
 
 
114 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45012  predicted protein  27.08 
 
 
437 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>