33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3177 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  100 
 
 
341 aa  702    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  39.24 
 
 
740 aa  261  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  37.03 
 
 
775 aa  248  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  34.22 
 
 
632 aa  179  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  25.62 
 
 
568 aa  97.1  4e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10394  anaphase promoting complex subunit Apc11, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01380)  40 
 
 
104 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.136684  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  41.18 
 
 
222 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49448  predicted protein  28.85 
 
 
270 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0291569  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47933  predicted protein  27.78 
 
 
848 aa  52.8  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.649047  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41951  predicted protein  35.78 
 
 
167 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00615517 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  36.71 
 
 
91 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  35.9 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  35.9 
 
 
442 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  41.18 
 
 
812 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10271  predicted protein  37.1 
 
 
82 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804871  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64707  associated with histones/Spt16/Pob3  42.86 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45472  predicted protein  38.71 
 
 
230 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.369869  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  34.78 
 
 
614 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  33.33 
 
 
67 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  40.38 
 
 
75 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01075  RING finger ubiquitin ligase (Tul1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12080)  34.29 
 
 
807 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0263562  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  36.54 
 
 
127 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0377  hypothetical protein  53.33 
 
 
935 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.750713 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58365  predicted protein  28.09 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  39.22 
 
 
439 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  36.96 
 
 
534 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33812  predicted protein  20.44 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.680191  normal  0.108909 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  36 
 
 
531 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34003  predicted protein  36.67 
 
 
450 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29935  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46942  predicted protein  50 
 
 
788 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37145  Skp1 Cullin-F-box ubiquitin protein ligase (SCF) subunit  39.53 
 
 
113 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49494  predicted protein  48.28 
 
 
235 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  32.43 
 
 
401 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>