21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64707 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_64707  associated with histones/Spt16/Pob3  100 
 
 
301 aa  620  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92878  predicted protein  30.49 
 
 
424 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.1562  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47516  predicted protein  31.51 
 
 
403 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  36 
 
 
1761 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  30.38 
 
 
972 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61460  predicted protein  46.34 
 
 
496 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0156696 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05681  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 10 (Eurofung)  36.54 
 
 
373 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141855  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  42.86 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05961  ATP-dependent protease (CrgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10470)  29.33 
 
 
623 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.870505  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29380  predicted protein  31.67 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336947  normal  0.515556 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  35.71 
 
 
1415 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58365  predicted protein  39.02 
 
 
311 aa  46.2  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26544  predicted protein  31.91 
 
 
192 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.295366  normal  0.0215447 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04455  hypothetical protein  25.81 
 
 
449 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.396752  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  41.46 
 
 
740 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28951  predicted protein  35.14 
 
 
422 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  32.26 
 
 
775 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93376  predicted protein  38.1 
 
 
674 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10307  SH3 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13880)  30.43 
 
 
914 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.297688 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24500  predicted protein  31.08 
 
 
619 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.758729 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07309  Postreplication repair E3 ubiquitin-protein ligase rad18 (EC 6.3.2.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q02398]  30.51 
 
 
443 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272681  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>