19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29380 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29380  predicted protein  100 
 
 
358 aa  716    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336947  normal  0.515556 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05681  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 10 (Eurofung)  27.73 
 
 
373 aa  136  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141855  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58365  predicted protein  26.58 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02120  peroxisome assembly protein per8 (peroxin-10), putative  23.91 
 
 
344 aa  63.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0454259  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26544  predicted protein  41.51 
 
 
192 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.295366  normal  0.0215447 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47516  predicted protein  43.64 
 
 
403 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10006  conserved hypothetical protein  31.06 
 
 
192 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.634786  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0377  hypothetical protein  36.73 
 
 
935 aa  47.4  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.750713 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64707  associated with histones/Spt16/Pob3  31.67 
 
 
301 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05961  ATP-dependent protease (CrgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10470)  48.72 
 
 
623 aa  46.6  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.870505  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24500  predicted protein  46.51 
 
 
619 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.758729 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26746  predicted protein  44.19 
 
 
173 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.115242  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  29.13 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04230  spliceosomal zinc finger-containing protein, putative  45.24 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  42.42 
 
 
740 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61460  predicted protein  40 
 
 
496 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0156696 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54326  GNAT family acetyltransferase with 2 zinc fingers  32.05 
 
 
221 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.51333  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  36.96 
 
 
972 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44747  predicted protein  26.39 
 
 
362 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0219967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>