32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45011 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  100 
 
 
376 aa  786    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45012  predicted protein  27.79 
 
 
437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  32.26 
 
 
231 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  31.62 
 
 
407 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42830  predicted protein  34.78 
 
 
295 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  30.97 
 
 
334 aa  57.4  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  39.22 
 
 
534 aa  53.5  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26251  predicted protein  48.89 
 
 
666 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305353  normal  0.554527 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37967  predicted protein  45.65 
 
 
220 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  45.45 
 
 
442 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28766  predicted protein  41.86 
 
 
143 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0634822  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  40 
 
 
403 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  43.4 
 
 
75 aa  50.1  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  45.65 
 
 
166 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  39.06 
 
 
537 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  35.19 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45305  predicted protein  28 
 
 
203 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  34.31 
 
 
439 aa  47.4  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  31.54 
 
 
551 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07840  hypothetical protein  38.64 
 
 
1117 aa  47  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  27.27 
 
 
417 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  41.67 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 
1025 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  41.94 
 
 
637 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  35.82 
 
 
831 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  41.86 
 
 
611 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29380  predicted protein  29.13 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336947  normal  0.515556 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  38 
 
 
67 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  28.89 
 
 
775 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47753  predicted protein  33.02 
 
 
700 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  38.64 
 
 
812 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10251  RING and UBP finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10360)  39.06 
 
 
503 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>