27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42830 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42830  predicted protein  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45012  predicted protein  31.36 
 
 
437 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  34.78 
 
 
376 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  41.67 
 
 
397 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  41.51 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  40 
 
 
1025 aa  49.3  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  49.02 
 
 
559 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  43.14 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  38.81 
 
 
611 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  46.67 
 
 
231 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47753  predicted protein  50 
 
 
700 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  30 
 
 
831 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46265  predicted protein  48.57 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  41.38 
 
 
75 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28766  predicted protein  28.87 
 
 
143 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0634822  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  39.34 
 
 
551 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  37.78 
 
 
637 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  34.07 
 
 
806 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  34.07 
 
 
1086 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37967  predicted protein  29.67 
 
 
220 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  33.82 
 
 
403 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54486  ferric reductase 1  39.58 
 
 
1326 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43986  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  37.88 
 
 
166 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  40 
 
 
812 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45305  predicted protein  32.81 
 
 
203 aa  42.7  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34718  predicted protein  36.54 
 
 
475 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151191  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  42 
 
 
537 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>