32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54486 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_54486  ferric reductase 1  100 
 
 
1326 aa  2753    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43986  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46928  ferric reductase 2  25.62 
 
 
656 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000397828  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50392  Ferric reductase, NADH/NADPH oxidase transmembrane component (5 domains)  21.89 
 
 
595 aa  77.8  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46265  predicted protein  33.58 
 
 
308 aa  72.8  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06030  conserved hypothetical protein  22.4 
 
 
677 aa  69.7  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444756  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05457  NADPH oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J0N4]  27.85 
 
 
550 aa  68.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0427037  normal  0.821467 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  34.95 
 
 
397 aa  66.6  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  48.08 
 
 
334 aa  62.4  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54982  ferric reductase  28.97 
 
 
746 aa  59.3  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.78 
 
 
254 aa  56.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59173  Ferric reductase, NADH/NADPH oxidase transmembrane component (7 domains)  20.2 
 
 
595 aa  56.2  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.135023 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  42.31 
 
 
67 aa  55.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  40.38 
 
 
407 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37967  predicted protein  37.04 
 
 
220 aa  53.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00950  metalloreductase, putative  22.22 
 
 
715 aa  52.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  35.82 
 
 
831 aa  52.4  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1554  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.62 
 
 
339 aa  51.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0185  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.62 
 
 
339 aa  51.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.420006  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1001  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  28.04 
 
 
339 aa  51.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0213  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.62 
 
 
339 aa  51.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.821344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2583  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  28.04 
 
 
339 aa  51.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2727  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.62 
 
 
339 aa  51.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1358  benzoate 1,2 dioxygenase, electron transfer component  27.62 
 
 
339 aa  51.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710358  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0471  benzoate 1,2-dioxygenase, ferredoxin reductase component  27.51 
 
 
338 aa  50.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.8 
 
 
261 aa  49.3  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_54409  ferric reductase  27.27 
 
 
746 aa  48.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33967  Ferric reductase transmembrane component 7 (Ferric-chelate reductase 7)  22.59 
 
 
592 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000164458  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  37.74 
 
 
127 aa  46.6  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  40.74 
 
 
231 aa  47  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.28 
 
 
419 aa  46.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  43.4 
 
 
551 aa  45.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  30.56 
 
 
307 aa  45.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>