More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1381 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  100 
 
 
307 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  62.14 
 
 
254 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.21 
 
 
261 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  32.8 
 
 
419 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  27.35 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  27.35 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  27.35 
 
 
402 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  27.35 
 
 
402 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  26.94 
 
 
402 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  27.35 
 
 
402 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 
402 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  26.53 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  26.12 
 
 
402 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.88 
 
 
447 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  30.74 
 
 
445 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.38 
 
 
444 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.74 
 
 
444 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  27.43 
 
 
402 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  28.9 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.02 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  24.51 
 
 
400 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.35 
 
 
399 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  24.8 
 
 
426 aa  87  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  27.89 
 
 
402 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.8 
 
 
360 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.45 
 
 
402 aa  86.7  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.82 
 
 
430 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  27.91 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  24.39 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  27.78 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  27.78 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  27.78 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  27.78 
 
 
402 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  27.78 
 
 
402 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  27.78 
 
 
402 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  27.78 
 
 
402 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.12 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.31 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.1 
 
 
687 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.52 
 
 
402 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  26.42 
 
 
402 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.22 
 
 
699 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.91 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.71 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.98 
 
 
686 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  26.14 
 
 
549 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.39 
 
 
691 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1179  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.69 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173064  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.63 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  24 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3155  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.91 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  24.03 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  24.42 
 
 
1148 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  25.21 
 
 
586 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28.63 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.78 
 
 
678 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.6 
 
 
357 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0423  flavohemoprotein  25.97 
 
 
394 aa  79  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  29.22 
 
 
395 aa  79  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  27.92 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  27.08 
 
 
678 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.75 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2780  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  27.73 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963847  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  27.07 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  23.69 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3517  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.91 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.611569  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  23.69 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.86 
 
 
690 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.63 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  27.69 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.59 
 
 
700 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  28.15 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  28.15 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.38 
 
 
465 aa  76.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  25.31 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.27 
 
 
390 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  27.13 
 
 
382 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5717  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.6 
 
 
369 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.16 
 
 
687 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  25.19 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  25.43 
 
 
394 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  23.43 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  29.95 
 
 
682 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 
1155 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.68 
 
 
681 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  29.03 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  26.97 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.91 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  23.29 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  24.69 
 
 
691 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.02 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  28.81 
 
 
581 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.69 
 
 
678 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.95 
 
 
929 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.98 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2438  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.27 
 
 
713 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145248  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  26.86 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.32 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.7 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  26.07 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>