41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47699 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  100 
 
 
231 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37967  predicted protein  27.14 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  59.62 
 
 
67 aa  70.1  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  32.26 
 
 
376 aa  62  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  52 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_24789  Predicted E3 ubiquitin ligase  40.62 
 
 
468 aa  56.6  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  38.33 
 
 
407 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45012  predicted protein  38.1 
 
 
437 aa  49.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  30.68 
 
 
775 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05845  RING-finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14845)  39.62 
 
 
114 aa  48.5  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  27.36 
 
 
442 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  25.12 
 
 
417 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54486  ferric reductase 1  40.74 
 
 
1326 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43986  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  36 
 
 
831 aa  46.2  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  42 
 
 
397 aa  46.2  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42830  predicted protein  46.67 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 
1025 aa  46.2  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  38.64 
 
 
401 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  32.38 
 
 
317 aa  46.2  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26278  predicted protein  45.65 
 
 
103 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.063384 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  34.21 
 
 
411 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  34.04 
 
 
403 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  44.19 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  36.17 
 
 
127 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  40.43 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  38.64 
 
 
537 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  37.21 
 
 
611 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47753  predicted protein  31.51 
 
 
700 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45305  predicted protein  41.18 
 
 
203 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  33.33 
 
 
568 aa  43.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  27.84 
 
 
632 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01075  RING finger ubiquitin ligase (Tul1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12080)  56 
 
 
807 aa  43.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0263562  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  34.88 
 
 
534 aa  42.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  36 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  37.74 
 
 
75 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26251  predicted protein  34.29 
 
 
666 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305353  normal  0.554527 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  32.69 
 
 
91 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46265  predicted protein  46.34 
 
 
308 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  36 
 
 
551 aa  42  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  32.2 
 
 
637 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03770  expressed protein  36.36 
 
 
433 aa  42  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>