46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49280 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  100 
 
 
317 aa  660    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  34.86 
 
 
551 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  43.18 
 
 
534 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  47.62 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  41.86 
 
 
611 aa  56.6  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  46 
 
 
559 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  46.51 
 
 
537 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  46.81 
 
 
75 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  50 
 
 
812 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  41.86 
 
 
238 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  51.16 
 
 
411 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  45.65 
 
 
1025 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  41.86 
 
 
531 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  38.6 
 
 
222 aa  50.4  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  28.87 
 
 
231 aa  49.3  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03770  expressed protein  42.86 
 
 
433 aa  49.3  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  37.7 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34003  predicted protein  43.14 
 
 
450 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29935  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  32.79 
 
 
127 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  33.33 
 
 
442 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  24.17 
 
 
334 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  33.33 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26278  predicted protein  40 
 
 
103 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.063384 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42830  predicted protein  43.14 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  43.18 
 
 
831 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58891  predicted protein  38.1 
 
 
596 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650086  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  34.88 
 
 
91 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  32.47 
 
 
166 aa  46.6  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  43.4 
 
 
397 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05845  RING-finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14845)  46.67 
 
 
114 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26251  predicted protein  31.67 
 
 
666 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305353  normal  0.554527 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  36.36 
 
 
1348 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00441  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04600)  44.68 
 
 
403 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  36.36 
 
 
637 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  32.08 
 
 
531 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49494  predicted protein  45.24 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46942  predicted protein  44.44 
 
 
788 aa  44.3  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  39.58 
 
 
632 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  41.86 
 
 
616 aa  43.9  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45305  predicted protein  33.33 
 
 
203 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34718  predicted protein  37.25 
 
 
475 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151191  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  41.38 
 
 
724 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  42.86 
 
 
614 aa  42.7  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  40 
 
 
67 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10251  RING and UBP finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10360)  33.33 
 
 
503 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  37.21 
 
 
403 aa  42.4  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>