34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL06290 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  100 
 
 
616 aa  1252    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  48.08 
 
 
531 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  46.43 
 
 
551 aa  62.8  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  43.48 
 
 
537 aa  57.4  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  35.42 
 
 
1025 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  37.97 
 
 
439 aa  54.3  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  41.07 
 
 
812 aa  53.9  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  32 
 
 
534 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  44.68 
 
 
559 aa  53.5  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  48.08 
 
 
411 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35 
 
 
1160 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  43.18 
 
 
238 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34003  predicted protein  39.62 
 
 
450 aa  50.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29935  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  42.37 
 
 
166 aa  50.4  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00441  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04600)  46 
 
 
403 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  46.81 
 
 
222 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03770  expressed protein  36.54 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  38.98 
 
 
417 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  39.51 
 
 
1300 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  36.17 
 
 
831 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  44.68 
 
 
442 aa  48.5  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  36.21 
 
 
637 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  40.43 
 
 
632 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  45.1 
 
 
75 aa  47.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  45.83 
 
 
91 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45012  predicted protein  33.33 
 
 
437 aa  45.4  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  39.13 
 
 
334 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  39.29 
 
 
611 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  32.58 
 
 
1220 aa  44.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  35 
 
 
1311 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  27.54 
 
 
401 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  40.38 
 
 
67 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  41.86 
 
 
317 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_24789  Predicted E3 ubiquitin ligase  28.57 
 
 
468 aa  43.9  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>