32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49801 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  100 
 
 
632 aa  1301    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  34.22 
 
 
341 aa  178  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 
740 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  29.88 
 
 
775 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  27.49 
 
 
568 aa  70.5  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03770  expressed protein  39.22 
 
 
433 aa  59.3  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 
534 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37967  predicted protein  38.46 
 
 
220 aa  56.2  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  27.91 
 
 
1415 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49448  predicted protein  33.33 
 
 
270 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0291569  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  39.29 
 
 
67 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  32.93 
 
 
403 aa  53.9  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  26.95 
 
 
403 aa  51.6  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  30.56 
 
 
401 aa  51.6  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  40 
 
 
1348 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  38.89 
 
 
439 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  36 
 
 
91 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  39.22 
 
 
407 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  34.18 
 
 
531 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  41.67 
 
 
166 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  38.46 
 
 
724 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  38.46 
 
 
616 aa  48.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  26.76 
 
 
222 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  32.26 
 
 
417 aa  47.4  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  36.84 
 
 
637 aa  47  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  33.33 
 
 
611 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  35.38 
 
 
1761 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  32.31 
 
 
831 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  35.09 
 
 
1025 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  40.91 
 
 
531 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  39.13 
 
 
537 aa  44.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  39.58 
 
 
317 aa  44.3  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>