23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01290 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  100 
 
 
740 aa  1527    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  40.05 
 
 
775 aa  303  6.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  39.24 
 
 
341 aa  261  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  31.27 
 
 
632 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  24.53 
 
 
568 aa  135  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  30.56 
 
 
67 aa  50.8  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  35.48 
 
 
724 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47933  predicted protein  26.72 
 
 
848 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.649047  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  31.87 
 
 
442 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12877  predicted protein  30.77 
 
 
234 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  39.22 
 
 
127 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  55.56 
 
 
614 aa  47.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  33.77 
 
 
401 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  30.28 
 
 
551 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  33.33 
 
 
812 aa  47  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39090  predicted protein  34.67 
 
 
134 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64707  associated with histones/Spt16/Pob3  41.46 
 
 
301 aa  45.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46942  predicted protein  30.3 
 
 
788 aa  45.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10394  anaphase promoting complex subunit Apc11, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01380)  42.86 
 
 
104 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.136684  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119493  RING-box protein 1  30.43 
 
 
110 aa  44.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0313077  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29380  predicted protein  42.42 
 
 
358 aa  44.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0336947  normal  0.515556 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33739  mating-type transcriptional regulator (putative)  40 
 
 
607 aa  44.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0111037  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  44.83 
 
 
91 aa  44.3  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>