33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84817 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  100 
 
 
568 aa  1176    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 
740 aa  141  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  25.2 
 
 
775 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  27.05 
 
 
341 aa  97.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  27.62 
 
 
632 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  70.37 
 
 
614 aa  57.4  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29546  predicted protein  34.38 
 
 
158 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0342735 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  24.2 
 
 
812 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  37.88 
 
 
537 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29739  predicted protein  56.25 
 
 
59 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.462514  normal  0.0294486 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33739  mating-type transcriptional regulator (putative)  48.57 
 
 
607 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0111037  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27170  predicted protein  56.25 
 
 
59 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.839995 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  52.78 
 
 
166 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00441  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04600)  35.71 
 
 
403 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  48.39 
 
 
222 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39090  predicted protein  34.33 
 
 
134 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119493  RING-box protein 1  30.3 
 
 
110 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0313077  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01075  RING finger ubiquitin ligase (Tul1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12080)  31.94 
 
 
807 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0263562  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  34.85 
 
 
67 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47753  predicted protein  31.91 
 
 
700 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  30.77 
 
 
551 aa  45.4  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  30.77 
 
 
127 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  53.85 
 
 
534 aa  44.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  31.76 
 
 
401 aa  44.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  27.94 
 
 
403 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  30.86 
 
 
611 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49494  predicted protein  44.12 
 
 
235 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47933  predicted protein  25.39 
 
 
848 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.649047  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08310  ligase, putative  41.03 
 
 
883 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  28.43 
 
 
531 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  29.41 
 
 
442 aa  43.9  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  35.59 
 
 
411 aa  43.9  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28766  predicted protein  30.14 
 
 
143 aa  43.5  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0634822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>