16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33739 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_33739  mating-type transcriptional regulator (putative)  100 
 
 
607 aa  1225    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0111037  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84869  predicted protein  54.29 
 
 
437 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58365  predicted protein  55.17 
 
 
311 aa  50.4  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  48.57 
 
 
568 aa  49.7  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  46.43 
 
 
611 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  46.88 
 
 
534 aa  48.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  44.83 
 
 
1415 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  39.51 
 
 
551 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  42.42 
 
 
740 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05681  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 10 (Eurofung)  46.43 
 
 
373 aa  44.3  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141855  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  44.44 
 
 
1761 aa  44.3  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  32.69 
 
 
222 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  58.33 
 
 
334 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  53.85 
 
 
401 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  34.78 
 
 
775 aa  43.5  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08310  ligase, putative  48.15 
 
 
883 aa  43.5  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>