37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46465 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  100 
 
 
401 aa  837    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  25.34 
 
 
442 aa  76.6  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  21.72 
 
 
417 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  30.56 
 
 
632 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  43.48 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  36.36 
 
 
831 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  40 
 
 
222 aa  50.1  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  34.78 
 
 
439 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  39.53 
 
 
551 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  37.7 
 
 
317 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  32.35 
 
 
724 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  35.19 
 
 
376 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 
740 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  38.89 
 
 
67 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  43.14 
 
 
403 aa  46.6  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  41.86 
 
 
238 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  38.64 
 
 
231 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26278  predicted protein  38.46 
 
 
103 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.063384 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  38.1 
 
 
534 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  36.21 
 
 
637 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  31.4 
 
 
568 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07294  PHD and RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16870)  53.85 
 
 
614 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0466722 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  27.54 
 
 
616 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  35.56 
 
 
531 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26251  predicted protein  38.64 
 
 
666 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305353  normal  0.554527 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  33.33 
 
 
403 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  38.1 
 
 
127 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  26.36 
 
 
559 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  40.38 
 
 
411 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05845  RING-finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14845)  41.86 
 
 
114 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33739  mating-type transcriptional regulator (putative)  53.85 
 
 
607 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0111037  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  31.51 
 
 
775 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47753  predicted protein  26.74 
 
 
700 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  34.78 
 
 
91 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  32.43 
 
 
341 aa  43.5  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  32.14 
 
 
407 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05051  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12190)  40.48 
 
 
133 aa  43.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000346837  hitchhiker  0.000000000224364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>