35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47912 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  100 
 
 
403 aa  835    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  25.45 
 
 
537 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  32.08 
 
 
812 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  32.53 
 
 
531 aa  63.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  33.72 
 
 
238 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00441  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04600)  51.02 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  43.86 
 
 
551 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  31.82 
 
 
637 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  35.48 
 
 
534 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  43.33 
 
 
559 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  44.07 
 
 
411 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  38.78 
 
 
1025 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  33.33 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  35.9 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  27.35 
 
 
632 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  42.31 
 
 
127 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28766  predicted protein  42.37 
 
 
143 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0634822  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  25.93 
 
 
442 aa  47.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  43.14 
 
 
91 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  36 
 
 
439 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  36.07 
 
 
417 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34718  predicted protein  44.44 
 
 
475 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151191  normal  0.0293051 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  37.5 
 
 
831 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  34.62 
 
 
611 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  25.23 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  29.03 
 
 
222 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  44.44 
 
 
531 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  27.69 
 
 
1198 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36079  predicted protein  32.43 
 
 
565 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  28.81 
 
 
67 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  27.34 
 
 
775 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  27.94 
 
 
568 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  33.33 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_24789  Predicted E3 ubiquitin ligase  33.77 
 
 
468 aa  43.5  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39062  Putative RING-H2 finger protein  32.79 
 
 
116 aa  43.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00515519  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>