32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46464 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  100 
 
 
417 aa  868    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  26.16 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  22.37 
 
 
401 aa  73.2  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  41.07 
 
 
537 aa  54.3  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  38.96 
 
 
775 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  30.39 
 
 
551 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  31.34 
 
 
1025 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  40.82 
 
 
831 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  24.35 
 
 
231 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  39.66 
 
 
616 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  38.64 
 
 
238 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  31.82 
 
 
812 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  46.81 
 
 
166 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45305  predicted protein  28.95 
 
 
203 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  39.62 
 
 
127 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  36.21 
 
 
67 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05845  RING-finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14845)  43.48 
 
 
114 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_19381  predicted protein  31.71 
 
 
379 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.797995  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  36.07 
 
 
403 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  27.27 
 
 
376 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  38.64 
 
 
531 aa  46.6  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  37.93 
 
 
632 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34003  predicted protein  31.25 
 
 
450 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29935  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54486  ferric reductase 1  28.44 
 
 
1326 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43986  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  28.1 
 
 
611 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  40.91 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  38.3 
 
 
1348 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  41.86 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49494  predicted protein  40.38 
 
 
235 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  31.03 
 
 
222 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
559 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 
534 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>