42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48034 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  100 
 
 
537 aa  1094    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  25.45 
 
 
403 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  50 
 
 
531 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  28.87 
 
 
534 aa  62.8  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  48 
 
 
559 aa  60.5  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  47.92 
 
 
127 aa  57.4  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  38.78 
 
 
238 aa  57.4  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  40.68 
 
 
611 aa  57  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34003  predicted protein  47.17 
 
 
450 aa  57  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29935  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  43.48 
 
 
616 aa  57  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  44.9 
 
 
812 aa  57  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  42.55 
 
 
551 aa  56.6  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  40.82 
 
 
637 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  45.65 
 
 
831 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46464  predicted protein  41.07 
 
 
417 aa  54.3  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.40023  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45305  predicted protein  31.96 
 
 
203 aa  53.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  45.65 
 
 
317 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  48.08 
 
 
75 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  48.84 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  44.9 
 
 
411 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
1025 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00441  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04600)  42.86 
 
 
403 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111828 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03770  expressed protein  38.89 
 
 
433 aa  50.8  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  36.36 
 
 
568 aa  50.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  38 
 
 
222 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  38.3 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  36.11 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  40.35 
 
 
334 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_24789  Predicted E3 ubiquitin ligase  37.78 
 
 
468 aa  48.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  39.58 
 
 
1348 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  38 
 
 
91 aa  47  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  37.7 
 
 
724 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  40.43 
 
 
166 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42830  predicted protein  44.23 
 
 
295 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  37.5 
 
 
67 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05051  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12190)  29.69 
 
 
133 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000000346837  hitchhiker  0.000000000224364 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05845  RING-finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14845)  34.69 
 
 
114 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  39.13 
 
 
632 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29739  predicted protein  41.67 
 
 
59 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.462514  normal  0.0294486 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  38.64 
 
 
231 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27170  predicted protein  41.67 
 
 
59 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.839995 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02070  cytoplasm protein, putative  34.92 
 
 
712 aa  43.5  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>