36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03930 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03930  RING zinc finger protein, putative  100 
 
 
637 aa  1293    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03770  expressed protein  29.57 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  46.81 
 
 
831 aa  59.7  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  40.68 
 
 
439 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48034  predicted protein  40.82 
 
 
537 aa  57.4  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0967386  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 
534 aa  56.6  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  35.9 
 
 
1025 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04130  conserved hypothetical protein  43.14 
 
 
559 aa  55.5  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0558219  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47912  predicted protein  31.82 
 
 
403 aa  53.9  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  33.82 
 
 
397 aa  53.5  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  36.73 
 
 
1348 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26544  predicted protein  31.76 
 
 
192 aa  50.4  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.295366  normal  0.0215447 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  28.33 
 
 
442 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06290  riken protein, putative  36.21 
 
 
616 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  32.84 
 
 
812 aa  48.5  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  34.04 
 
 
531 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  40.35 
 
 
222 aa  48.5  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10271  predicted protein  38.33 
 
 
82 aa  47.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804871  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  41.94 
 
 
376 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  36.84 
 
 
632 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  38.46 
 
 
67 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  36.21 
 
 
401 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  38.78 
 
 
334 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32341  predicted protein  39.22 
 
 
127 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0453773  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  36.96 
 
 
551 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  27.87 
 
 
724 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_24789  Predicted E3 ubiquitin ligase  40.91 
 
 
468 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  34.04 
 
 
611 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  31.48 
 
 
1086 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26251  predicted protein  41.67 
 
 
666 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305353  normal  0.554527 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  36.36 
 
 
317 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  39.58 
 
 
75 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  31.48 
 
 
806 aa  44.3  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01658  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 
238 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00486685  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42830  predicted protein  37.78 
 
 
295 aa  43.9  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08310  ligase, putative  39.47 
 
 
883 aa  43.5  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>