23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47754 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  100 
 
 
407 aa  849    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  44.07 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38045  predicted protein  32.89 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.160362  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  31.62 
 
 
376 aa  60.1  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  45.45 
 
 
439 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47753  predicted protein  25.14 
 
 
700 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54486  ferric reductase 1  40.38 
 
 
1326 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43986  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  25.54 
 
 
231 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37967  predicted protein  42.86 
 
 
220 aa  52.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14355  predicted protein  36.84 
 
 
67 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0220417  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  39.22 
 
 
632 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45874  predicted protein  39.29 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  36.21 
 
 
403 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03770  expressed protein  31.03 
 
 
433 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  29.69 
 
 
534 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45012  predicted protein  26.92 
 
 
437 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  28.28 
 
 
1348 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  42.55 
 
 
531 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26278  predicted protein  42.22 
 
 
103 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.063384 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  33.33 
 
 
972 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45305  predicted protein  37.25 
 
 
203 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  32.14 
 
 
401 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  43.4 
 
 
611 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>