25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119493 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119493  RING-box protein 1  100 
 
 
110 aa  226  7e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0313077  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39090  predicted protein  74.16 
 
 
134 aa  155  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08844  RING-box protein 1 (Broad)  54.65 
 
 
116 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.43925  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37145  Skp1 Cullin-F-box ubiquitin protein ligase (SCF) subunit  52.22 
 
 
113 aa  100  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03140  ubiquitin-protein ligase, putative  50 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0134629  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10271  predicted protein  33.33 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804871  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_9831  predicted protein  34.78 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.320101 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10394  anaphase promoting complex subunit Apc11, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01380)  30.11 
 
 
104 aa  49.7  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.136684  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  30.3 
 
 
568 aa  46.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 
740 aa  44.7  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  31.15 
 
 
442 aa  43.9  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01488  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04840)  32.26 
 
 
775 aa  43.5  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  46.88 
 
 
551 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  53.85 
 
 
611 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  31.67 
 
 
341 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  28.12 
 
 
724 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08310  ligase, putative  48 
 
 
883 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  52.17 
 
 
534 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33739  mating-type transcriptional regulator (putative)  56.52 
 
 
607 aa  41.6  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0111037  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09421  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G03900)  33.33 
 
 
411 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0254179  hitchhiker  0.00000000188492 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00190  hypothetical protein  37.5 
 
 
705 aa  40.8  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05681  microbody (peroxisome) biogenesis protein peroxin 10 (Eurofung)  46.88 
 
 
373 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141855  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84869  predicted protein  34.78 
 
 
437 aa  40.4  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01075  RING finger ubiquitin ligase (Tul1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12080)  29.58 
 
 
807 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0263562  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46043  predicted protein  43.9 
 
 
334 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>