16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46942 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_46942  predicted protein  100 
 
 
788 aa  1637    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01075  RING finger ubiquitin ligase (Tul1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12080)  29.67 
 
 
807 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0263562  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49448  predicted protein  30.69 
 
 
270 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0291569  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08310  ligase, putative  29.13 
 
 
883 aa  101  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  51.43 
 
 
1348 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  36.07 
 
 
534 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93376  predicted protein  42.11 
 
 
674 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  41.03 
 
 
611 aa  48.5  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  37.7 
 
 
222 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  57.69 
 
 
531 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  32.39 
 
 
724 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  35.94 
 
 
75 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37967  predicted protein  35.44 
 
 
220 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.480413  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 
740 aa  45.4  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  50 
 
 
341 aa  44.3  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49280  predicted protein  44.44 
 
 
317 aa  44.3  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>