More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3009 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
254 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  62.14 
 
 
307 aa  331  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  54.98 
 
 
261 aa  291  6e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  33.64 
 
 
419 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  26.32 
 
 
402 aa  96.3  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  25.4 
 
 
402 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.05 
 
 
447 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  25.4 
 
 
402 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  25.4 
 
 
402 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  25.4 
 
 
402 aa  92.4  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  25.51 
 
 
402 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  33.2 
 
 
447 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  25.51 
 
 
402 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.96 
 
 
465 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.87 
 
 
401 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.11 
 
 
430 aa  89.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  25 
 
 
402 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  29.85 
 
 
1148 aa  88.6  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.46 
 
 
401 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  24.6 
 
 
402 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  24.6 
 
 
402 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  30.86 
 
 
445 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  32.23 
 
 
339 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  32.23 
 
 
339 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  32.23 
 
 
339 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3456  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.4 
 
 
221 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0147103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.04 
 
 
444 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  30.27 
 
 
352 aa  85.1  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.45 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  30.49 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  31.8 
 
 
356 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  31.15 
 
 
625 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  29.57 
 
 
597 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  27.05 
 
 
627 aa  83.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  31.28 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  26.58 
 
 
678 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.16 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3322  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.98 
 
 
691 aa  82  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.138588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  31.8 
 
 
346 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  31.8 
 
 
346 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.37 
 
 
702 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  26.89 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.26 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2519  oxidoreductase FAD-binding region  29.95 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  25.1 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.83 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.49 
 
 
699 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  25.69 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.4 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  26.88 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0497  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.65 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.1 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.16 
 
 
1138 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.52 
 
 
681 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.42 
 
 
678 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.8 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.11 
 
 
399 aa  79.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  28 
 
 
375 aa  79  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26490  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.8 
 
 
360 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.365765  normal  0.166146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  30.18 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  26.97 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.69 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.09 
 
 
232 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000975827  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.42 
 
 
678 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  27.69 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2807  MOSC domain containing protein  27.92 
 
 
549 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  26.56 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3813  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.79 
 
 
428 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.56 
 
 
494 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.86 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  26.76 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  26.29 
 
 
402 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  30.99 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.17 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  27.65 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4806  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.65 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.23 
 
 
675 aa  75.9  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  28.29 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  24.71 
 
 
586 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08610  Benzoate 1,2-Dioxygenase Reductase  26.59 
 
 
336 aa  75.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.57 
 
 
669 aa  75.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.84 
 
 
368 aa  75.1  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.57 
 
 
677 aa  75.1  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  26.12 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.9 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2477  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.81 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.23 
 
 
687 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  28.4 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.14 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.57 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.28 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  28 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.91 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2612  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.46 
 
 
362 aa  74.3  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.23 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  25.93 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  29.11 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  25.41 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  27.2 
 
 
670 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2905  fused nitric oxide dioxygenase and dihydropteridine reductase  24.7 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.690195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>