More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2003 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  70.56 
 
 		 217 aa  308  5e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 216 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  67.61 
 
 		 220 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  67.61 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  67.61 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  69.08 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  64.45 
 
 		 239 aa  283  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  68.45 
 
 		 228 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  68.45 
 
 		 228 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  68.45 
 
 		 228 aa  281  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  67.32 
 
 		 218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  62.81 
 
 		 213 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  69.12 
 
 		 216 aa  272  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  60.19 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.43 
 
 		 223 aa  268  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  61.68 
 
 		 214 aa  268  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.44 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.39 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  65.71 
 
 		 225 aa  261  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.44 
 
 		 222 aa  261  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  60.85 
 
 		 223 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.71 
 
 		 233 aa  247  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  65.37 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  58.33 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 212 aa  241  6e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.81 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.32 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  56.04 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.57 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 231 aa  236  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  55.12 
 
 		 211 aa  234  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.35 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  55.39 
 
 		 224 aa  231  9e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  53.66 
 
 		 218 aa  231  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  57.92 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.5 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 213 aa  226  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 209 aa  224  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  53.05 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 244 aa  222  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 216 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.4 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.24 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.6 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1992  response regulator receiver protein  69.92 
 
 		 137 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108622  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.23 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  44.5 
 
 		 224 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  39.52 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.42 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 213 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  38.24 
 
 		 218 aa  151  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5474  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.344108  normal  0.73382 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  37.32 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.4 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 223 aa  148  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.93 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.86 
 
 		 219 aa  144  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.03 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  36.62 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  39.3 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 222 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 207 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0615  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 222 aa  141  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1701  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0169479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2145  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 220 aa  141  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0196231  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 303 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  36.1 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.58 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0973  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.255067  normal  0.404517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>