More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1665 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
515 aa  962    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.86 
 
 
511 aa  500  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.08 
 
 
514 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  52.92 
 
 
502 aa  362  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.8 
 
 
511 aa  350  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  48.9 
 
 
515 aa  325  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
530 aa  310  4e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.97 
 
 
500 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
509 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
528 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 
526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.54 
 
 
531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
536 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
526 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
526 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
530 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.83 
 
 
518 aa  278  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 
522 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
536 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  40.24 
 
 
512 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
530 aa  267  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.72 
 
 
521 aa  266  7e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
527 aa  266  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  40.35 
 
 
528 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
528 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
527 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
503 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.13 
 
 
528 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
521 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
521 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
521 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
521 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
525 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
525 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  42.83 
 
 
532 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  39.69 
 
 
534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.25 
 
 
534 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
543 aa  239  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
526 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
536 aa  238  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.7 
 
 
526 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
533 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  36.31 
 
 
513 aa  233  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
523 aa  232  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
541 aa  232  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.41 
 
 
506 aa  223  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
536 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
540 aa  208  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
545 aa  206  9e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  38.07 
 
 
507 aa  203  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  36.83 
 
 
1057 aa  202  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 
540 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
550 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
530 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.4 
 
 
568 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
538 aa  153  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
562 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
549 aa  150  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.47 
 
 
555 aa  147  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.1 
 
 
567 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0315  iron ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
538 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0768  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.1 
 
 
558 aa  141  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
550 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 
533 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0245  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33 
 
 
538 aa  140  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  30.92 
 
 
553 aa  140  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
544 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  31.5 
 
 
529 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 
538 aa  136  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
540 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
554 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
559 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0743  iron(III) ABC transporter, permease protein  29.15 
 
 
544 aa  134  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.31 
 
 
561 aa  133  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368895 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1546  ABC iron transporter, inner membrane subunit  26.97 
 
 
564 aa  133  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.424688  normal  0.358419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
540 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.154251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.497984  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
556 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
557 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.81 
 
 
544 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 
544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.55 
 
 
570 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 
528 aa  127  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  27.02 
 
 
555 aa  126  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68890  putative iron ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 
539 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 
550 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
582 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
566 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
543 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
589 aa  123  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1525  ABC transporter, permease protein  25.05 
 
 
526 aa  124  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
543 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.73 
 
 
543 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.25371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0667  iron(III) ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
542 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603449  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.46 
 
 
543 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>